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在四川，大西军出川后，与豪格，吴三桂连续大战数十场，却败多胜少。
而张献忠接连遭遇失败，战局十分不妙，西军节节败退，同时后方明朝参将杨展趁机反攻。
西军两面受敌，杨展领兵夺川南州县，率师北上，与西军的激战于彭山的江口，败西军，杨展由南面逼向成都，同时豪格率清军又攻克汉中，进逼川中，四川的北大门已然洞开。
张献忠怒不可遏，决定放弃成都，张献忠率部离开成都，北上迎击清军。
张献忠集兵二十万余，进驻西充凤凰山，可由于部下刘进忠出卖，引清军自汉中出巴裕关，折向西行沿东河谷地到达南部及西充，对西军所在凤凰山进行了突然袭击。
清兵猝至，疏于防备的张献忠猝不及防，西军虽被突袭，却尚能勉强维持，可不知何处飞来一支流矢，正正射中张献忠，主帅生死不知，西军人心惶惶，在清军突袭下西军随即大败。
张可望，张定国，张文秀，张能奇四个义子，急托扶张献忠撤离，张献忠临死前，他对四个义子说道：“明廷三百年正统，未必遽绝，亦天意也。我死，尔急归明，毋为不义”。
随后四人草草安葬张献忠后，率部南下，归降永历帝。
而永历帝收到西军决定投降的消息，泪流满面，这个时候的永历君臣再没有历史上对西军不屑一顾，朝堂上下说怪话的场景了，什么贼寇曾焚毁皇陵，什么张贼大逆不道，擅自称帝等等，这些话无一人提及，朝堂上下，有口皆赞，不是说义民赤胆忠心，便是说国之危亡，干臣扶保天子。
永历君臣被邵武朝廷打的是溃不成军，而堵胤锡又是效忠邵武帝，他已经在变东督师忠贞营，至于江南孟浚对两个朝廷都是敷衍态度，天下诸将中，永历朝廷在兵力实力上，已经落于下风。
于是，永历帝对这大西军的投靠犹如是一根救命稻草一般，封赏恩赐，夸耀之旨意，一日十余道，连发至西营中。
在张献忠死后，四个义子纷纷恢复原姓，孙可望被永历帝加封为晋王，李定国封为秦王，刘文秀封为蜀王，而艾能奇兵力较少，则被封为定北王。
永历朝廷信心满满，认为数十万大军，且身经百战的义军加入，平灭邵武伪帝，已是易事。
孙可望一脸惊疑的看着不时传达旨意的锦衣卫，迎接旨意的香案，那是摆了又撤，撤了又摆，索性到后面便一直摆着，省的来来回回的麻烦。
李定国感叹，若是昔日在谷城时，朝廷如此优待，说不定义父便不反了，何至于今日，李定国已经数不清和官军究竟厮杀了多少次，可如今自己却又变成了官军。
天下纷乱不休，唯有孟浚无心明廷之事，他的目光死死的盯着南都，此时的沈廷杨已经率水师五千人，大小战船两百余艘，北上长江，阻拦勒克德浑回师。